Глава 1 - Пробуждение Вне Времени
Сюжет начинается с момента, когда Адриан Шепард, бывший солдат спецподразделения HECU, пребывает в стазисе — это результат вмешательства загадочного G-Man’а в финале Half-Life: Opposing Force. Внезапно стазис нарушается: Шепарда телепортирует в неизвестное место и время.
Он оказывается в будущем — 25 декабря 2051 года. Мир вокруг кажется мёртвым: выцветшие зелёные заборы, искривлённые деревья, редкий снежный налёт, тишина и отсутствие признаков жизни. Шепард не узнаёт окружающий мир и понимает, что это больше не его эпоха. Он начинает исследовать местность, охваченный растерянностью.
Однако вскоре он испытывает временной скачок и перемещается в другое время — на этот раз в 2020 год, 19 октября. На окраине города, рядом с гаражами, где природа ещё жива и всё кажется знакомым, Шепард замечает странную активность. Позади него внезапно появляется патруль временной полиции — бойцы из организации Управление Временных Изменений (УВИ).
Офицеры заявляют, что из-за непреднамеренных скачков Шепарда во времени начали образовываться неконтролируемые временные ответвления. Не понимая сути происходящего и не доверяя незнакомцам, Адриан вступает в бой, ранив одного из патрульных и пытаясь сбежать. Однако он падает, спотыкается, и схватка продолжается. Один из офицеров наносит точный удар по лицу Шепарда, выводя его из строя.
Очнувшись, Адриан обнаруживает себя в изоляторе — специальной тюрьме вне времени. Туда вскоре доставляют ещё одного «временного преступника». Им оказывается альтернативная версия Барни Калхуна, охранника из вселенной, где катастрофа в Чёрной Мезе так и не произошла. Между ними возникает осторожный контакт, и они решают объединиться для побега.
Вскоре они слышат подозрительный звук, похожий на открытие ворот, и используют момент для побега. Однако, наступив на электромину, оба оказываются оглушены. Повезло: охранники были отвлечены загадочным зелёным свечением, позволившим героям улизнуть.
Они приходят в себя, связанные, перед неким человеком по имени Дэлай Черновский. Он предлагает им «сотрудничество» с неясными целями. Герои отказываются. Дэлай уходит, оставляя их обдумать решение. Барни освобождается первым, но не помогает Шепарду, полагая, что тот справится сам.
Адриан освобождается и начинает поиски выхода, но внезапно сталкивается с Дэлаем. Тот с помощью браслета управления физическим пространством обездвиживает Шепарда и сбрасывает его вниз, вызывая потерю сознания. Затем отдаёт приказ перенести его в другое место.
Параллельно Барни продолжает искать выход. Он замечает детали, указывающие на временные искажения: бутылку с водой, ржавые стены и звуки, которые не должны быть в этой зоне. Он начинает подозревать, что они находятся в другом времени или что изолятор больше не подчиняется законам времени.
Барни находит Адриана в полуобморочном состоянии, но перед ними снова появляется Дэлай. Барни вступает с ним в бой, но браслет даёт Дэлаю преимущество. Тогда Адриан, собрав последние силы, нападает сзади, что даёт Барни шанс нанести удар. Вдвоём они выводят Дэлая из строя и сбегают.
Герои бегут по лабиринту изолятора, понимая, что оказались втянутыми в войну вне времени, и что всё только начинается.